欧盟新移民协议旨在协调庇护程序、公平分配寻求庇护者并减少非法越境。然而，希腊已采取更严厉措施，要求庇护申请被拒者在两周内离境，否则将被视为非法滞留并可能被拘留。与协议中规定的为遣返做准备的临时拘留不同，希腊自九月起已开始因非法越境和非法居留起诉被拒庇护者，最高刑期可达五年。 希腊移民部长塔诺斯·普莱夫里斯表示，已有750人根据新规被捕。在莱斯博斯岛等地，警方在庇护申请者收到最终拒批通知后立即逮捕他们。 难民营中的援助人员报告称，此类事件日益增多，导致庇护申请者出现严重的心理问题，如噩梦和恐慌。 一名来自塞内加尔的男子表示，他担心被监禁，此前已经在土耳其被拘留过三个月。 他的庇护申请已被希腊当局两次拒绝，因为希腊认为塞内加尔是安全的国家。