Une controverse entoure la potentielle démission de Prof. Abdul Mu'ti de son poste de secrétaire général du conseil central de Muhammadiyah, suite à sa nomination au poste de ministre de l'Éducation de base et intermédiaire indonésien. Des opinions divergentes sont apparues quant à la nécessité pour M. Mu'ti de quitter ses fonctions actuelles. La question centrale réside dans la compatibilité entre ses responsabilités gouvernementales et son rôle au sein de l'organisation religieuse. Pour l'instant, il n'est pas obligatoire pour lui de démissionner. Le débat souligne l'importance de la gouvernance et des conflits d'intérêts potentiels dans le contexte de la nomination de personnalités religieuses à des postes gouvernementaux. La situation est suivie de près par les observateurs politiques et religieux en Indonésie.