मोज़ाम्बिक में, परिवहन सब्सिडी कार्यक्रम को लेकर कुछ शहरों ने असहयोग दिखाया है। शाई-शाई, इनहम्बाने और चिमोइओ जैसे नगर पालिकाओं ने सब्सिडी लेने के बजाय किराए में वृद्धि करने का विकल्प चुना है। परिवहन और लॉजिस्टिक्स मंत्रालय के अनुसार, सब्सिडी प्राप्त करने वाले ट्रांसपोर्टरों की पहचान और भुगतान की प्रक्रिया ऑडिट के तहत है, और अनियमितता पाए जाने पर जवाबदेही तय की जाएगी। मंत्रालय ने ईंधन की कीमतों में वृद्धि के बाद लाइसेंस प्राप्त ट्रांसपोर्टरों की संख्या की जांच के बाद पहली महीने की सब्सिडी का भुगतान किया है, लेकिन कुछ ट्रांसपोर्टरों ने इसे अस्वीकार कर दिया है। भविष्य के भुगतानों के लिए ट्रांसपोर्टरों के सत्यापन को दोहराया जाएगा। सरकार को FEMATRO (रोड ट्रांसपोर्टर्स एसोसिएशन का फेडरेशन) से अंतर-प्रांतीय किराए पर एक प्रस्ताव भी मिला है, जिसकी अभी मंजूरी बाकी है। तीन महीने की सब्सिडी अवधि के बाद, ईंधन खर्चों पर बेहतर नियंत्रण के लिए परिवहन प्रणाली में एक निगरानी प्रणाली स्थापित की जाएगी।