28 अप्रैल को शाम 4:27 बजे, कुमामोतो प्रांत में एक भूकंप आया, जिसकी तीव्रता 7.1 मापी गई। कुमामोतो प्रांत के उकि शहर और हिकवा-माची में 7 की तीव्रता के झटके महसूस किए गए। कुमामोतो शहर के मिनमी-कु, यात्सुशिरो शहर, उतो शहर, मिसतो-माची और इकिशिरो-माची में 6 मजबूत तीव्रता के झटके दर्ज किए गए। ऊपरी अमाकुसा शहर, गोशी शहर, ओत्सु-माची, निशिहारा-सन, मिफुन-माची और आशीकिता-माची में 6 कमजोर तीव्रता के झटके महसूस किए गए। मौसम विज्ञान एजेंसी के अनुसार, भूकंप का केंद्र कुमामोतो प्रांत में था और इसकी गहराई 10 किलोमीटर थी। इस भूकंप के कारण, अरिमा-उमी और यात्सुशिरो-उमी क्षेत्रों में सुनामी की चेतावनी जारी की गई है।