1996 में, राउल कास्त्रो क्यूबा की क्रांतिकारी सशस्त्र सेनाओं के मंत्री थे। उन पर 1996 की घटना में शामिल होने की जांच चल रही है, जिसमें चार लोग मारे गए थे। इस घटना में संयुक्त राज्य अमेरिका के स्वामित्व वाले विमानों को क्यूबा के हवाई क्षेत्र में मार गिराया गया था। अब, कास्त्रो के खिलाफ गिरफ्तारी वारंट जारी किया गया है, जो इस घटना में उनकी संभावित भूमिका के कारण है। क्यूबा सरकार ने इस मामले पर अभी तक कोई आधिकारिक टिप्पणी नहीं की है। यह मामला अंतर्राष्ट्रीय स्तर पर भी महत्वपूर्ण है क्योंकि इसमें दो देशों के बीच हवाई क्षेत्र से संबंधित विवाद शामिल है। जांचकर्ता कास्त्रो की उस समय की भूमिका और आदेश की श्रृंखला का पता लगाने की कोशिश कर रहे हैं जिसके कारण विमानों को मार गिराया गया।